LE VIRUS VENU DE CHINE mais on peut pas tout à fait dire que c'est de leur faute et on les apprécie beaucoup, On croirait que c’est la Peste Noire de 1300 et quelques Options

[Miles]

https://twitter.com/lemondefr/status/1372797428160598020?s=19

— CulturePSG (@CulturePSG) November7, 2011

[parizien]

Ils pourraient fermer les cantines au moins.
En gros le but c’est de désengorger ce qu’on peut jusqu’aux vacances dans 3 semaines, en misant sur météo et la vaccination des personnes les plus à risque terminée.

Faudra penser à une gestion pour les variants résistants, que ça ne nous répète pas à la gueule cet été.

comment tu veux fermer les cantines ?

[Zivan]

https://twitter.com/lemondefr/status/1372797428160598020?s=19

— CulturePSG (@CulturePSG) November7, 2011

Spoiler :

Covid-19 : après les variants, des recombinants du SARS-CoV-2 détectés

Cette nouvelle mutation, découverte au Royaume-Uni, est un mélange de deux variants du coronavirus. Mais selon les chercheurs, l’arrivée de ces « recombinants » était attendue et « n’aura pas immédiatement de conséquences sur la trajectoire épidémique ».

Cela devait arriver. Après les variants qui se transmettent plus, puis ceux qui limitent l’efficacité des vaccins, voici les virus « recombinants » du SARS-CoV-2. Ces nouveaux venus sont, comme les précédents, des façons d’augmenter la diversité génétique du virus, et donc d’obtenir des comportements différents plus adaptés à leur environnement. Ce sont en fait des chimères, faites de deux segments de génomes raboutés et empruntés à deux lignées différentes du SARS-CoV-2. Ou comment créer un virus à partir de deux.

Comme pour les premiers variants, l’alerte est venue du Royaume-Uni. L’équipe chargée des séquençages et de leur analyse, le consortium COG-UK, a révélé sur le site spécialisé Virological.org, mercredi 17 mars, les onze premiers recombinants de la jeune histoire de ce virus, répartis en quatre groupes, avec, chacun, deux ou trois représentants identiques. Quatre autres recombinants, « putatifs », présents en un seul exemplaire, sont aussi décrits.

Tous ont des bouts de séquence provenant du variant identifié fin 2020 en Angleterre, baptisé « B.1.1.7 » ou « 501Y.V1 ». Le reste est fait, au choix, de deux « vieilles » lignées. Début février, une première alerte avait été émise depuis les Etats-Unis, lors d’une conférence rapportée par le magazine New Scientist, concernant un recombinant d’un variant « anglais » avec un autre local, mais sans confirmation depuis.

« Des champions de la recombinaison intergénomique »

La nouvelle ne surprend pas Hubert Laude, vétérinaire retraité, pionnier de la recherche sur les coronavirus. « [Ce] sont des champions de la recombinaison intergénomique », constate-t-il, en rappelant que les chauves-souris hébergent, sans risque, énormément de coronavirus, qui se plaisent à se recombiner en leur sein pour acquérir de nouvelles fonctions.

Ces recombinaisons ont lieu lorsqu’une enzyme, la polymérase, « lit » le brin d’ARN viral en s’accrochant à lui pour le recopier. Ce processus peut avoir des ratés, avec une polymérase qui ralentit, s’arrête et prend un autre brin à recopier, ajoutant cette nouvelle séquence à la précédente.

« Le SARS-CoV-2 a un génome plus long que d’autres virus, ce qui augmente les chances d’accident. Sa polymérase est aussi moins “serrée” sur les brins », complète Bruno Canard, directeur de recherche au Centre national de la recherche scientifique (CNRS), à l’université Aix-Marseille.

Recombinaisons fréquentes

Les recombinaisons sont donc fréquentes, au point que c’est sans doute par ce mécanisme que l’une des protéines-clés du SARS-CoV-2, la spicule, est apparue. En tout cas, l’analyse du génome du pangolin a montré qu’un bout de sa spicule avait été acquis par recombinaison ; sans toutefois expliquer, malgré la similitude, l’adaptation et le passage à l’humain.

Mais seule une analyse statistique fine permet de distinguer ce qui serait le résultat d’une accumulation de mutations de celui d’un raboutage brutal, comme dans les chimères. Celles-ci n’ont, par exemple, pas plus de mutations que les lignées dites « variantes ». « D’ailleurs, au moment de l’apparition du variant anglais B.1.1.7, et de ses multiples mutations, on pensait d’abord à une recombinaison », rappelle Nicolas Bierne, généticien des populations CNRS à l’Institut des sciences de l’évolution de Montpellier. Mais l’arrangement de ces mutations est différent, ouvrant encore le champ des possibles. « Des coronavirus de chauve-souris ont ainsi “emprunté” les capacités à s’accoler à un récepteur d’une autre espèce à d’autres coronavirus par recombinaison », rappelle Hubert Laude.

« Une arrivée qui était attendue »

Les chercheurs anglais excluent des erreurs dans leur analyse. Les recombinaisons peuvent très bien se faire in vitro, lors des différentes étapes du séquençage, qui amplifient et cassent les génomes. Cependant, la détection de ces recombinants dans des laboratoires différents, et avec des coupures exactement au même endroit dans les séquences, leur permet d’avoir confiance dans leur identification. Au point qu’ils n’hésitent pas à « préempter » la découverte, en suggérant déjà de baptiser ces mutants en leur adjoignant la lettre X…

Cette émergence n’arrive pas maintenant par hasard. Pour qu’elle ait lieu, il faut des co-infections, c’est-à-dire qu’une cellule d’un même individu soit infectée par deux souches différentes en même temps. « Etant donné que plusieurs pays connaissent des incidences aussi fortes que celles au Royaume-Uni à la fin de 2020, nous prédisons que des recombinaisons seront plus souvent détectées si des efforts intenses de séquençages sont maintenus », écrivent les Britanniques. Pour trouver, il faut en effet chercher.

« L’arrivée des recombinants était attendue, mais n’aura pas immédiatement de conséquences sur la trajectoire épidémique », rassurent les chercheurs dans l’article. Leur rareté plaide pour l’absence de caractère plus transmissible, par exemple. Pour l’instant, car un recombinant peut aussi muter et engendrer un… variant problématique.

[voolool]

comment tu veux fermer les cantines ?

En les faisant manger dans des classes aérées par groupe?

[Miles]

Spoiler :

Covid-19 : après les variants, des recombinants du SARS-CoV-2 détectés

Cette nouvelle mutation, découverte au Royaume-Uni, est un mélange de deux variants du coronavirus. Mais selon les chercheurs, l’arrivée de ces « recombinants » était attendue et « n’aura pas immédiatement de conséquences sur la trajectoire épidémique ».

Cela devait arriver. Après les variants qui se transmettent plus, puis ceux qui limitent l’efficacité des vaccins, voici les virus « recombinants » du SARS-CoV-2. Ces nouveaux venus sont, comme les précédents, des façons d’augmenter la diversité génétique du virus, et donc d’obtenir des comportements différents plus adaptés à leur environnement. Ce sont en fait des chimères, faites de deux segments de génomes raboutés et empruntés à deux lignées différentes du SARS-CoV-2. Ou comment créer un virus à partir de deux.

Comme pour les premiers variants, l’alerte est venue du Royaume-Uni. L’équipe chargée des séquençages et de leur analyse, le consortium COG-UK, a révélé sur le site spécialisé Virological.org, mercredi 17 mars, les onze premiers recombinants de la jeune histoire de ce virus, répartis en quatre groupes, avec, chacun, deux ou trois représentants identiques. Quatre autres recombinants, « putatifs », présents en un seul exemplaire, sont aussi décrits.

Tous ont des bouts de séquence provenant du variant identifié fin 2020 en Angleterre, baptisé « B.1.1.7 » ou « 501Y.V1 ». Le reste est fait, au choix, de deux « vieilles » lignées. Début février, une première alerte avait été émise depuis les Etats-Unis, lors d’une conférence rapportée par le magazine New Scientist, concernant un recombinant d’un variant « anglais » avec un autre local, mais sans confirmation depuis.

« Des champions de la recombinaison intergénomique »

La nouvelle ne surprend pas Hubert Laude, vétérinaire retraité, pionnier de la recherche sur les coronavirus. « [Ce] sont des champions de la recombinaison intergénomique », constate-t-il, en rappelant que les chauves-souris hébergent, sans risque, énormément de coronavirus, qui se plaisent à se recombiner en leur sein pour acquérir de nouvelles fonctions.

Ces recombinaisons ont lieu lorsqu’une enzyme, la polymérase, « lit » le brin d’ARN viral en s’accrochant à lui pour le recopier. Ce processus peut avoir des ratés, avec une polymérase qui ralentit, s’arrête et prend un autre brin à recopier, ajoutant cette nouvelle séquence à la précédente.

« Le SARS-CoV-2 a un génome plus long que d’autres virus, ce qui augmente les chances d’accident. Sa polymérase est aussi moins “serrée” sur les brins », complète Bruno Canard, directeur de recherche au Centre national de la recherche scientifique (CNRS), à l’université Aix-Marseille.

Recombinaisons fréquentes

Les recombinaisons sont donc fréquentes, au point que c’est sans doute par ce mécanisme que l’une des protéines-clés du SARS-CoV-2, la spicule, est apparue. En tout cas, l’analyse du génome du pangolin a montré qu’un bout de sa spicule avait été acquis par recombinaison ; sans toutefois expliquer, malgré la similitude, l’adaptation et le passage à l’humain.

Mais seule une analyse statistique fine permet de distinguer ce qui serait le résultat d’une accumulation de mutations de celui d’un raboutage brutal, comme dans les chimères. Celles-ci n’ont, par exemple, pas plus de mutations que les lignées dites « variantes ». « D’ailleurs, au moment de l’apparition du variant anglais B.1.1.7, et de ses multiples mutations, on pensait d’abord à une recombinaison », rappelle Nicolas Bierne, généticien des populations CNRS à l’Institut des sciences de l’évolution de Montpellier. Mais l’arrangement de ces mutations est différent, ouvrant encore le champ des possibles. « Des coronavirus de chauve-souris ont ainsi “emprunté” les capacités à s’accoler à un récepteur d’une autre espèce à d’autres coronavirus par recombinaison », rappelle Hubert Laude.

« Une arrivée qui était attendue »

Les chercheurs anglais excluent des erreurs dans leur analyse. Les recombinaisons peuvent très bien se faire in vitro, lors des différentes étapes du séquençage, qui amplifient et cassent les génomes. Cependant, la détection de ces recombinants dans des laboratoires différents, et avec des coupures exactement au même endroit dans les séquences, leur permet d’avoir confiance dans leur identification. Au point qu’ils n’hésitent pas à « préempter » la découverte, en suggérant déjà de baptiser ces mutants en leur adjoignant la lettre X…

Cette émergence n’arrive pas maintenant par hasard. Pour qu’elle ait lieu, il faut des co-infections, c’est-à-dire qu’une cellule d’un même individu soit infectée par deux souches différentes en même temps. « Etant donné que plusieurs pays connaissent des incidences aussi fortes que celles au Royaume-Uni à la fin de 2020, nous prédisons que des recombinaisons seront plus souvent détectées si des efforts intenses de séquençages sont maintenus », écrivent les Britanniques. Pour trouver, il faut en effet chercher.

« L’arrivée des recombinants était attendue, mais n’aura pas immédiatement de conséquences sur la trajectoire épidémique », rassurent les chercheurs dans l’article. Leur rareté plaide pour l’absence de caractère plus transmissible, par exemple. Pour l’instant, car un recombinant peut aussi muter et engendrer un… variant problématique.

Merci, tweet putaclic

Par contre je croyais que c'était écarté cette histoire de pangolin ?

[Oyé Sapapaya]

On peut pas fermer les classes en décalant la fin d'année scolaire fin juillet ?

[parizien]

En les faisant manger dans des classes aérées par groupe?

Impossible à faire ça niveau logistique.
Et par groupe, ça veut dire que la pause déjeuner va prendre 3h et que certains vont manger super tard, impensable.

[ramutcho]

En les faisant manger dans des classes aérées par groupe?

Ca demande beaucoup trop de personnels ou alors, effectivement, la pause déjeuner dure 3h.

[Jocelyn Golmon]

Ils pourraient fermer les cantines au moins.

"Quoi qu'il en coute !"

[Le Cyclone]

On peut pas fermer les classes en décalant la fin d'année scolaire fin juillet ?

Non car tout l'écosystème du tourisme français a besoin de ces 2 mois de congés pour sortir la tête de l'eau.

[Kaelas]

Impossible à faire ça niveau logistique.
Et par groupe, ça veut dire que la pause déjeuner va prendre 3h et que certains vont manger super tard, impensable.

Ca se fait déjà dans certain bahut mais bon.

[voolool]

"Quoi qu'il en coute !"

Ca se fait déjà dans certain bahut mais bon.

Ca ne rate jamais.

Dans le Rhône-Alpes (?) ils vont équiper les salles de purificateurs, j'ai également cru lire.

On en est où sinon du champoing anti-poux victime d'un complot alors qu'un youtubeur mandaté par l'OMS a fait une vidéo pour dire que ca marche en se mettant de la vitamine D dans le cul?

Voolool >>> culture prof, pandémie et logistique.

[parizien]

Ca se fait déjà dans certain bahut mais bon.

Oui pour des ados.
Mais pour le primaire c'est impossible.

[Befa]

AstraZeneca : la vaccination va reprendre seulement pour les plus de 55 ans

Feu vert à la reprise des injections de vaccin AstraZeneca… mais uniquement chez les personnes âgées d’au moins 55 ans. Telle est la recommandation de la Haute autorité de Santé (HAS), suivie par le gouvernement. Le produit avait été suspendu lundi après-midi, en raison de quelques cas « atypique » de thrombose possiblement lié à ce vaccin recensés en Europe. L’Agence européenne des médicaments (EMA) a indiqué jeudi que ce vaccin était « sûr et efficace » et qu’il n’y avait pas, à ce stade, de lien avéré avec les effets secondaires de type coagulation sanguine et thrombose. Dans la foulée, Jean Castex a annoncé que les piqûres reprendraient ce vendredi après-midi.

Mais la HAS rappelle que l’EMA « a identifié un possible surrisque de coagulation intravasculaire disséminée et de thrombophlébite cérébrale chez les personnes de moins de 55 ans ». C’est la raison pour laquelle l’agence « recommande à ce stade de n’utiliser le vaccin AstraZeneca que pour les personnes âgées de 55 ans et plus, qui constituent la très grande majorité des personnes prioritaires actuelles ». Cela constitue un sacré revirement par rapport à la situation initiale, puisque les personnes âgées d’au moins 65 ans ne pouvaient au départ pas se faire vacciner avec AstraZeneca.

Jean Castex, 55 ans, vacciné ce vendredi après-midi
« L’âge est le facteur principal de risque qui expose les personnes à développer des formes graves de la maladie », a indiqué lors d’un point presse Dominique Le Guludec, la présidente de la HAS. « Nous avons pour les plus jeunes des alternatives », a-t-elle aussi indiqué, faisant notamment référence aux vaccins à ARN messager de Pfizer et de Moderna. Le produit de Johnson&Johnson est ensuite attendu à partir de mi-avril.

Pour les personnes de moins de 55 ans et qui ont déjà une dose de vaccin AstraZeneca, la HAS « se positionnera très prochainement sur les modalités d’administration de la seconde dose ». De nombreux soignants sont concernés, à commencer par le ministre de la Santé Olivier Véran lui-même, même si l’on ne dispose pas du chiffre précis par vaccin et par tranche d’âge.

Cette question des deuxièmes injections ne se pose a priori pas dans l’immédiat, puisque l’écart recommandé entre les deux doses est de douze semaines. Or, les injections AstraZeneca ont débuté le 6 février (avant une forte accélération fin février), soit il y a 6 semaines.

Le ministère de la Santé indique au Parisien qu’il suit cette nouvelle recommandation de la HAS. L’un des premiers vaccinés après la suspension sera d’ailleurs le Premier ministre lui-même. Âgé de… 55 ans, il recevra une première injection ce vendredi en début d’après-midi. Le but est de « rassurer » la population, alors que de nombreux médecins craignent que la confiance ne s’amenuise. Au 18 mars, un peu plus d’1,4 million de personnes ont reçu une première dose de vaccin AstraZeneca.

Le Parisien

[Artza]

Bien débile cette histoire de plus de 55 ans

[ramutcho]

Oui pour des ados.
Mais pour le primaire c'est impossible.

On peut les laisser sans surveillance mais bon

[RegardZehef]

Un prof de mon entourage vient de m’envoyer une vidéo de la cantine du lycée Buffon, c’est n’importe quoi t’as genre 150 gamins sans masques qui bouffent à l’intérieur et sans aucune distanciation sociale


J’imagine que le traçage est bien fait

[Pastk]

Un prof de mon entourage vient de m’envoyer une vidéo de la cantine du lycée Buffon, c’est n’importe quoi t’as genre 150 gamins sans masques qui bouffent à l’intérieur et sans aucune distanciation sociale


J’imagine que le traçage est bien fait

Dans le même genre : une collègue a déjeuné avec quelqu’un qui s’avère positif. Réponse de la direction : t’es pas cas contact, si apparition de symptômes, vas te faire tester.
Je précise que je travaille pour l’administration d’état

[Thimax]

Les mecs qui découvrent un an plus tard que la maojorité des restrictions à la con c'est du grand-n'importe-quoi

Il ne doit plus qu'y avoir que les médecins de plateau TV corrompus ou des gros débils genre voolool pour croire à cette masquerade.

[Parisian]

Dans le même genre : une collègue a déjeuné avec quelqu’un qui s’avère positif. Réponse de la direction : t’es pas cas contact, si apparition de symptômes, vas te faire tester.
Je précise que je travaille pour l’administration d’état

Personne pour expliquer a ces fdp que c’est à cause de ces idiots qu’on en est au 3e confinement ?